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肿瘤SNV 野生型 ctDNA 标准品
货号 |
单位规格 |
库存 |
浓度 |
GW-OCTM005 |
0.5 μg/支 |
9999 |
20 ng/µL |
相比组织检测,液体活检方便,快速,即时,便宜,微创的特点,使其迅速成为目前肿瘤基因检测甚至是肿瘤早筛的研究热门。然而,由于DNA片段小,半衰期短,低丰度,肿瘤治疗过程中含量逐渐减少,正常细胞DNA污染,不同检测方法等一系列因素的限制,结果准确性没有统一标准。
菁良科技的ctDNA标准品适用于液体活检各过程:从文库制备,变异检测,到信息分析;同时适用于各检测方法:NGS测序,PCR检测等。
肿瘤SNV 野生型 ctDNA 标准品主要用于二代测序过程中 ctDNA 变异检测的阴性对照。可与肿瘤结构变异 5% ctDNA标准品,肿瘤SNV 5% ctDNA 标准品,肿瘤SNV 1-25% ctDNA 标准品等配合使用。
浓度 |
20 ng/µL |
保存溶剂 |
Tris-EDTA (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0 |
存储温度 |
2-8˚C |
保质期 |
36个月 |
规格 |
0.5 μg/支 |
检测项目 |
检测方法 |
质量标准 |
等位基因突变频率/基因型 |
微滴式数字PCR |
AF=0%, 可接受范围 ≤0.1%
AF<1%,可接受误差范围 = ±50%
1%≤AF<5%, 可接受误差范围 = ±40%
5%≤AF<10%, 可接受误差范围 = ±30%
10%≤AF, 可接受误差范围 = ±20%
注意:0.1%位点检测到的AF值必须比对应野生型位点高至少0.05% |
片段分布 |
4150 TapeStation System |
片段平均长度160 bp±10% |
浓度 |
Qubit® 4.0 Fluorometer |
20 ng/µL±15% |
序号 |
突变类型 |
基因位点 |
CDS突变 |
突变频率/拷贝数 |
COSMIC编号 (COSMIC v96) |
染色体编号 |
染色体位置(GRCh38) |
1 |
SNV
|
AKT1 E17K
|
c.49G>A |
0%
|
COSM33765
|
14 |
104780214
|
2 |
SNV
|
BRAF V600E
|
c.1799T>A
|
0% |
COSM476
|
7 |
140753336
|
3 |
SNV |
EGFR G719S |
c.2155G>A |
0% |
COSM6252
|
7 |
55174014
|
4 |
SNV
|
EGFR L858R
|
c.2573T>G
|
0%
|
COSM6224
|
7 |
55191822
|
5 |
SNV
|
EGFR T790M
|
c.2369C>T
|
0%
|
COSM6240
|
7 |
55181378
|
6 |
Insertion
|
EGFR A767_V769dup
|
c.2300_2308dup CCAGCGTGG |
0%
|
COSM12376
|
7 |
55181317-55181318 |
7 |
Deletion
|
EGFR E746_A750del
|
c.2235_2249del15
|
0%
|
COSM6225
|
7 |
55174773-55174787
|
8 |
SNV
|
KRAS A146T
|
c.436G>A
|
0%
|
COSM19404
|
12 |
25225628
|
9 |
SNV
|
KRAS G12D |
c.35G>A |
0%
|
COSM521 |
12 |
25245350 |
10 |
SNV
|
KRAS G13D |
c.38G>A |
0%
|
COSM532
|
12 |
25245347 |
11 |
SNV
|
NRAS Q61K |
c.181C>A
|
0%
|
COSM580 |
1 |
114713909
|
12 |
SNV
|
PIK3CA E545K
|
c.1633G>A |
0%
|
COSM763 |
3 |
179218303 |
13 |
SNV
|
PIK3CA H1047R
|
c.3140A>G
|
0%
|
COSM775 |
3 |
179234297
|
14 |
Fusion |
CD74(6)-ROS1(34) |
CD74(6)-ROS1(34) |
0%
|
COSF1200 |
6,5 |
117324415,150404680 |
15 |
Fusion |
EML4(6)-ALK(20) |
EML4(6)-ALK(20) |
0% |
COSF474
|
2,2 |
42264951,29223528 |
16 |
CNV |
ERBB2 Amplification |
NA |
2 copies |
NA |
17 |
39687914-39730426 |
17 |
CNV |
MET Amplification |
NA |
2 copies |
NA |
7 |
116672196-116798386 |
- 作为肿瘤SNV ctDNA 标准品的阴性对照
-
与肿瘤SNV ctDNA 系列产品混合得到其它的等位基因突变频率
-
结合肿瘤SNV ctDNA 系列产品使用,设置不同突变频率梯度,验证流程的精确性
以下文件命名格式为产品货号-产品批次号-产品文件类型
SMS-GW-OCTM005-A1 产品说明书: |
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GW-OCTM005-202209261-产品实测值: |
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GW-OCTM005-202209261-COA: |
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GW-OCTM005-202106001-COA: |
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: |
未上传文件 |
GW-OCTM005-202106001-数字PCR实测值: |
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GW-OCTM005-202103001-COA: |
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GW-OCTM005-202103001-数字PCR实测值: |
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